Часто Задаваемые Вопросы;pdf

Белорусский государственный медицинский университет
Гомельский государственный медицинский университет
Полиморфизм гена
интерлейкина-28В (ИЛ28В)
и его клиническое значение
в белорусской популяции
Жаворонок С.В., д.м.н., проф.
Мицура В.М., Воропаев Е.В.
Республиканский обучающий семинар с международным участием
«Актуальные инфекции детей в XXI веке» Минск 28.11.2014г
1
Что такое IL-28b?
Цитокин с иммунномодулирующей активностью.
Открыт в 2003 году.
Относится к семейству λ- интерферона:
• IL29 (λ1- интерферон)
• IL28A (λ2- интерферон)
• IL28B (λ3- интерферон)
Ген, кодирующий IL-28b, находится на 19 хромосоме.
В структуре гена (ДНК) возможны замены нуклеотидов
(A, T, G, C) – «полиморфизм гена».
Аллели - различные формы одного и того же гена,
расположенные в одинаковых участках (локусах)
гомологических хромосом.
Республиканский обучающий семинар с международным участием
«Актуальные инфекции детей в XXI веке» Минск 28.11.2014г
2
IL28B and the Control of Hepatitis C Virus Infection
Ashwin Balagopal, David L. Thomas and Chloe L. Thio
// Gastroenterology Volume 139, Issue 6, P. 1865-1876 (December 2010)
Республиканский обучающий семинар с международным участием
«Актуальные инфекции детей в XXI веке» Минск 28.11.2014г
3
Частота аллеля -IL28B rs12979860-C
в мире (Thomas DL et al., 2009)
Республиканский обучающий семинар с международным участием
«Актуальные инфекции детей в XXI веке» Минск 28.11.2014г
4
Частота стойкого вирусологического ответа и частота встречаемости
rs12979860 C-аллеля у различных этнических групп (D.Ge et al., 2009)
Генетические факторы организма человека влияют на эффективность
лечения ХГС, так как имеются этнические различия в ответе на лечение.
Республиканский обучающий семинар с международным участием
«Актуальные инфекции детей в XXI веке» Минск 28.11.2014г
5
IL-28B при гепатите С
 Единичные нуклеотидные полиморфизмы (SNP) в гене
интерлейкина-28B (IL-28B) коррелируют с УВО при лечении
пациентов PegIFN/RBV [Thomas DL et al., 2009; Ge D. et al., 2009].
 Более высокая прогностическая ценность благоприятного ответа
на лечение у пациентов с 1 генотипом HCV у 2 SNP: rs12979860,
и rs8099917 [Suppiah V et al.,2009; C.Lin et al., 2011].
Процент стойкого
вирусологического ответа на
интерферонотерапию в
зависимости от генотипа IL-28b
rs12979860. (По D.Ge et al., 2009)
Республиканский обучающий семинар с международным участием
«Актуальные инфекции детей в XXI веке» Минск 28.11.2014г
6
Роль IL-28 в противовирусной защите
↑ экспрессия стимулированных интерфероном генов (ISG) ассоциировалась с
↓ СВО. IL28B-CC→ ↓ экспрессия ISG → ↑СВО.
Активация эндогенной системы интерферона может препятствовать ответу на
терапию, вызывая рефрактерное состояние ИФН сигнального пути.
Республиканский обучающий семинар с международным участием
«Актуальные инфекции детей в XXI веке» Минск 28.11.2014г
7
Характеристика пациентов
Обследовано 156 пациентов с хронической
HCV-инфекцией в г.Гомеле и в г.Минске
(Беларусь).
65,4% мужчин, средний возраст от 16 до 75
лет (средний возраст 40,6±0,9 лет).
Стадия цирроза печени – 14,4%.
Генотип 1 HCV – 62,4%.
Республиканский обучающий семинар с международным участием
«Актуальные инфекции детей в XXI веке» Минск 28.11.2014г
8
Методы исследования
Для выявления точечных мутаций SNP
39743165T>G (rs8099917) и SNP 39738787C>T
(rs12979860) гена IL-28B (классификация NCBI)
использовали метод ПЦР-ПДРФ с
применением технологии миссматч-праймеров.
Используемые праймеры были синтезированы
по нашему заказу фирмой «Primetech»
(Беларусь).
В качестве материала для исследования
использовалась ДНК, выделенная из
лейкоцитов периферической крови пациентов.
Республиканский обучающий семинар с международным участием
«Актуальные инфекции детей в XXI веке» Минск 28.11.2014г
9
Анализ частоты встречаемости rs8099917
у 156 больных ХГС и 226 лиц общей популяции
Центральной Европы (GenBank)
Р<0,0001
[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/­projects/SNP/snp_ref.cgi?rs=8099917]
10
Республиканский обучающий семинар с международным участием
«Актуальные инфекции детей в XXI веке» Минск 28.11.2014г
Анализ частоты встречаемости rs12979860
гена IL-28b у 154 больных ХГС и в
европейской популяции
Р<0,0001
*Группа сравнения: из публ. Thomas DL et al., 2009 (n=642)
11
Республиканский обучающий семинар с международным участием
«Актуальные инфекции детей в XXI веке» Минск 28.11.2014г
Сравнение частот полиморфизмов
rs8099917 и rs12979860
rs8099917
rs12979860
ТТ
TG
GG
СС
51
1
0
СТ
21
53
4
ТТ
5
12
7
Республиканский обучающий семинар с международным участием
«Актуальные инфекции детей в XXI веке» Минск 28.11.2014г
Совпадение
«благоприятных»
генотипов ТТ и СС
33,1%,
Совпадение
гетерозиготных
вариантов TG и CT –
34,4%,
Совпадение
мутантных вариантов
GG и TT – 4,5%.
Всего: совпадений
72%.
12
Генотипы HCV у лиц с различными
вариантами гена IL-28B (N=143)
rs8099917
χ2=10,6; р=0,0011
rs12979860
χ2=14,1; р=0,0002
Республиканский обучающий семинар с международным участием
«Актуальные инфекции детей в XXI веке» Минск 28.11.2014г
13
Частота встречаемости различных вариантов гена
IL-28B в зоне rs8099917 у лиц, ответивших и не
ответивших на лечение ИФН-а (n=74)
Отношение шансов (OR, 95% ДИ)
ответа на терапию у пациентов с
«благоприятным» генотипом ТТ в
зоне rs8099917 по сравнению с
генотипами TG или GG.
OR = 3,6 (1,3–10,0).
Республиканский обучающий семинар с международным участием
«Актуальные инфекции детей в XXI веке» Минск 28.11.2014г
14
Частота встречаемости различных вариантов гена IL-28B
в зоне rs12979860
у лиц, ответивших и не ответивших на лечение ИФН-а
(n=74)
Отношение шансов (OR, 95% ДИ)
ответа на терапию у пациентов с
«благоприятным» генотипом CC в
зоне rs12979860 по сравнению с
генотипами CT или TT.
OR = 9,0 (2,7–30,6).
Республиканский обучающий семинар с международным участием
«Актуальные инфекции детей в XXI веке» Минск 28.11.2014г
15
Алгоритм обследования перед началом терапии
гепатита С (ЗАО «НПФ ДНК-Технология»)
Республиканский обучающий семинар с международным участием
«Актуальные инфекции детей в XXI веке» Минск 28.11.2014г
16
Генетические полиморфизмы, ассоциированные с
устойчивостью к лечению ХГС ИФН и РБВ
ПОЛИМОРФИЗМ:
ГЕН, ЗАМЕНА [ОБОЗНАЧЕНИЕ
В NCBI]
ГЕНОТИП
IL28B
T>G
Частота (ГОМЕЛЬ-МИНСК)
С/С
Возможно спонтанное разрешение
инфекции
Около 80% пациентов с ХГС отвечают на
лечение
Характерна высокая вирусная нагрузка
С/Т
20-40% пациентов с ХГС отвечают на
лечение
51%
Т/Т
20-25% пациентов с ХГС отвечают на
лечение
16%
Т/Т
Возможно спонтанное разрешение
инфекции
51%
G/T
Сниженный ответ на терапию
интерфероном и рибавирином
42%
G/G
Низкий ответ на терапию интерфероном
и рибавирином
IL28B
C>T
[rs12979860]
ВОЗМОЖНЫЕ ПРОЯВЛЕНИЯ ПОЛИМОРФИЗМА
[rs8099917]
34%
7%
© (ЗАО «НПФ ДНК-Технология»);
оригинальные данные В.М. Мицура, С.В. Жаворонок, Е.В.Воропаев (2013)
Республиканский обучающий семинар с международным участием
«Актуальные инфекции детей в XXI веке» Минск 28.11.2014г
17
Заключение
Впервые в популяции белорусских пациентов с хронической
HCV-инфекцией с помощью оригинальной методики установлена
частота аллельных вариантов rs8099917 и rs12979860 гена IL28B. Частоты мутантных аллелей были выше, чем в общей
популяции Европейского региона.
У пациентов с 1 генотипом HCV чаще встречаются мутантные
аллели в SNP rs8099917 (р=0,001) и rs12979860 (р=0,0002), что
уменьшает у них вероятность ответа на терапию.
У ответивших на терапию по сравнению с не-ответившими чаще
встречаются «благоприятные» генотипы TT в зоне rs8099917 и
СС в зоне rs12979860; шанс ответа на терапию у них в 4-9 раз
выше.
Тестирование SNP гена IL-28B (в большей степени rs12979860)
позволяет точнее прогнозировать ответ на терапию у пациентов с
ХГС, что особенно важно для пациентов с генотипом 1 HCV. Для
пациентов с гомозиготным носительством «неблагоприятных»
аллелей следует предлагать схемы лечения, не включающие
интерферон.
Республиканский обучающий семинар с международным участием
«Актуальные инфекции детей в XXI веке» Минск 28.11.2014г
18